故事一开始就是一名失忆症患者漂流在大海，被一艘意大利籍渔船救上船，这名垂死的失忆症患者身上中了两枪，臀部被植入一枚晶片，晶片上面竟然有一个瑞士银行帐号。他虽然失去记忆，也完全不知道自己的身份或背景，但是他却拥有一身惊人的技艺，包括高强的武艺、精通多种语言的能力以及遇到危险时敏捷的自卫能力。他为了找到自己的身份以及解开围绕在他身边的谜团，于是游遍欧洲各国踏上一趟惊险的冒险旅程。他先是在瑞士银行帐号的保险箱内发现各国的护照、一笔包含各国货币的钜款、一把自动手枪以及一个名字－－杰森包恩－－还有一个巴黎的住址。这一切仍然是谜，但是包恩很快就发现虽然他谁也不认识，却有很多人认得他，而且这些人似乎都狠不得将他除之为快。他在逃避追捕时遇到一名德籍女孩玛莉柯卢兹，他在情急之下提议要付她一万美元，条件是她必须开车载他到巴黎。原本不太愿意的玛莉在金钱的诱惑下和包恩一起旅行，也改变了她的一生。包恩原以为神不知鬼不觉的逃亡行动却仍然留下线索，他出现的消息也从欧洲传回美国维吉尼亚州兰利市的中情局总部，原来包恩是一名顶尖中情局干员，负责执行一项被称为"绊脚石"的暗杀行动，当包恩在暗杀行动失败后出现在欧洲，他的上司为了要保密，决定将他尽快除掉，于是包恩必须凭著他过人的本领躲避追杀，并保护玛莉的安全。